La cepa del virus A (H1N1) pdm09 utilizada en la vacuna atenuada contra la influenza fue cambiada para la temporada de 2015-2016 debido a su falta de efectividad en niños pequeños en 2013-2014.

Michael L. Jackson y colaboradores de la Universidad de Michigan, evaluaron el efecto de este cambio en cuanto la eficacia de la vacuna contra la influenza en 2015-2016. Para ello, inscribieron a infantes de 6 meses o mayores que presentaban síntomas respiratorios agudos en clínicas de atención ambulatoria en sitios geográficamente diversos de los Estados Unidos. Usando un diseño de prueba negativa, se estimó la efectividad de la inmunización [(1 - OR) × 100], donde OR  corresponde al odds ratio para las pruebas positivas para el virus de la gripe entre los vacunados versus los participantes no inmunizados. Finalmente, se calcularon estimaciones separadas para las vacunas inactivadas y la formulación en base al virus atenuado.

Entre 6.879 participantes elegibles, 1.309 (19%) dieron positivo para el virus, predominantemente para A (H1N1) pdm09 (11%) e influenza B (7%). La efectividad de la vacuna contra cualquier enfermedad tipo influenza fue del 48% (IC del 95%: 41 a 55; P <0,001). Entre los niños de 2 a 17 años de edad, la vacuna inactivada fue 60% efectiva (IC del 95%: 47 a 70, P <0,001), mientras que la versión atenuada no fue efectiva (eficacia del 5%, IC del 95%: - 47 a 39; P = 0,80). Por último,  la vacuna inactivada contra A (H1N1) pdm09 entre los niños otorgó una protección de un 63% (45 a 75, P <0,001) y la formulación atenuada un -19% (-113 a 33, P = 0,55).

En conclusión, las formulaciones redujeron el riesgo de enfermedad en el período 2015-2016. Sin embargo, la versión atenuada resultó ser ineficaz entre los niños en un año, mientras que la vacuna inactivada mostró una sustancial efectividad. Debido a que la cepa 2016-2017 A (H1N1) pdm09 utilizada en la vacuna atenuada permaneció sin cambios desde 2015-2016, el Comité Consultivo sobre Prácticas de Inmunización recomienda no utilizar la versión atenuada para la temporada de 2016-2017.